Удаление неиспользуемых файлов в папке /upload/iblock/

Скрипт удалит только те файлы, которые отсутствуют в таблице БД b_file

Создайте файл delete.php в корне сайта и скопируйте в него код, расположенный ниже.

<?php
 require($_SERVER["DOCUMENT_ROOT"] . "/bitrix/header.php");
  
 global $USER;
 if (!$USER->IsAdmin()) {
     echo "Авторизуйтесь как администратор.";
     return;
 }
 $time_start = microtime(true);
 echo '<br>';
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////
  
 define("NO_KEEP_STATISTIC", true);
 define("NOT_CHECK_PERMISSIONS", true);
  
 $deleteFiles = 'no'; //Удалять ли найденные файлы yes/no
 $saveBackup = 'no'; //Создаст бэкап файла yes/no
 //Папка для бэкапа
 $patchBackup = $_SERVER['DOCUMENT_ROOT'] . "/upload/backup_files/";
 //Целевая папка для поиска файлов
 $rootDirPath = $_SERVER['DOCUMENT_ROOT'] . "/upload/iblock";
 //$rootDirPath = $_SERVER['DOCUMENT_ROOT'] . "/upload/support"; // Чтобы удалить в модуле техподдержка надо раскомментировать
 //$rootDirPath = $_SERVER['DOCUMENT_ROOT'] . "/upload/support/not_image"; //Чтобы удалить из данной папки
	//Создание папки для бэкапа
	 if (!file_exists($patchBackup)) {
	     CheckDirPath($patchBackup);
	 }
	  
	 // Получаем записи из таблицы b_file
	 $arFilesCache = array();
	 $result = $DB->Query('SELECT FILE_NAME, SUBDIR FROM b_file WHERE MODULE_ID = "iblock"'); //Тут меняем iblock на support, чтобы удалить в модуле техподдержка
	 while ($row = $result->Fetch()) {
	     $arFilesCache[$row['FILE_NAME']] = $row['SUBDIR'];
	 }
	  
	  
	 $hRootDir = opendir($rootDirPath);
	 $count = 0;
	 $contDir = 0;
	 $countFile = 0;
	 $i = 1;
	 $removeFile=0;
	 while (false !== ($subDirName = readdir($hRootDir))) {
	     if ($subDirName == '.' || $subDirName == '..') {
	         continue;
	     }
	     //Счётчик пройденых файлов
	     $filesCount = 0;
	     $subDirPath = "$rootDirPath/$subDirName"; //Путь до подкатегорий с файлами
	     $hSubDir = opendir($subDirPath);
	     
	     while (false !== ($fileName = readdir($hSubDir))) {
	         if ($fileName == '.' || $fileName == '..') {
	             continue;
	         }
	         $countFile++;
	  
	         if (array_key_exists($fileName, $arFilesCache)) { //Файл с диска есть в списке файлов базы - пропуск
	             $filesCount++;
	             continue;
	         }
	         $fullPath = "$subDirPath/$fileName"; // полный путь до файла
	         $backTrue = false; //для создание бэкапа
	         if ($deleteFiles === 'yes') {
	             if (!file_exists($patchBackup . $subDirName)) {
	                 if (CheckDirPath($patchBackup . $subDirName . '/')) { //создал поддиректорию
	                     $backTrue = true;
	                 }
	             } else {
	                 $backTrue = true;
	             }
	             if ($backTrue) {
	                 if ($saveBackup === 'yes') {
	                     CopyDirFiles($fullPath, $patchBackup . $subDirName . '/' . $fileName); //копия в бэкап
	                 }
	             }
	             //Удаление файла
	             if (unlink($fullPath)) {
	                 $removeFile++;
	                 echo "Удалил: " . $fullPath . '<br>';
	             }
	         } else {
	             $filesCount++;
	             echo 'Кандидат на удаление - ' . $i . ') ' . $fullPath . '<br>';
	         }
	         $i++;
	         $count++;
	         unset($fileName, $backTrue);
	     }
	     closedir($hSubDir);
	     //Удалить поддиректорию, если удаление активно и счётчик файлов пустой - т.е каталог пуст
	     if ($deleteFiles && !$filesCount) {
	         rmdir($subDirPath);
	     }
	     $contDir++;
	 }
	 if ($count < 1) {
	     echo 'Не нашёл данных для удаления<br>';
	 }
	  if ($saveBackup === 'yes') {
	      echo 'Бэкап файлов поместил в: <strong>' . $patchBackup . '</strong><br>';
	  }
	 echo 'Всего файлов удалил: <strong>' . $removeFile . '</strong><br>';
	 echo 'Всего файлов в ' . $rootDirPath . ': <strong>' . $countFile . '</strong><br>';
	 echo 'Всего подкаталогов в ' . $rootDirPath . ': <strong>' . $contDir . '</strong><br>';
	 echo 'Всего записей в b_file: <strong>' . count($arFilesCache) . '</strong><br>';
	 closedir($hRootDir);
	  
	  
	 ////////////////////////////////////////////////////////////////////
	 echo '<br>';
	 $time_end = microtime(true);
	 $time = $time_end - $time_start;
	  
	 echo "Время выполнения $time секунд\n";
	 require($_SERVER["DOCUMENT_ROOT"] . "/bitrix/footer.php");
	 ?>

После этого запустите данный файл, и дождитесь конца операции.